Fondatorul are următoarele drepturi și obligații principale:
a) aprobă planul de dezvoltare a incubatorului de afaceri, la propunerea administratorului incubatorului de afaceri;
b) stabilește drepturile și obligațiile specifice ale administratorului incubatorului de afaceri, conform prezentei legi și regulamentului de selectare și numire a administratorului incubatorului de afaceri;
c) urmărește îndeplinirea obligațiilor de către administratorul incubatorului de afaceri;
d) solicită administratorului incubatorului de afaceri elaborarea raportului de activitate anual, până la data de 30 martie a anului următor;
e) transmite raportul de activitate al administratorului incubatorului de afaceri, autorității administrației publice centrale cu atribuții în domeniul întreprinderilor mici și mijlocii și mediului de afaceri, în termen de 15 zile de la primirea raportului de activitate, însoțit de punctele proprii de vedere privind îndeplinirea obligațiilor administratorului.