Bunurile ce alcătuiesc infrastructura de îmbunătățiri funciare aparținând domeniului public al statului se transmit în administrarea Agenției, prin protocol de predare-preluare aprobat prin ordin al ministrului agriculturii, pădurilor și dezvoltării rurale, cu specificarea obligațiilor acesteia privind exploatarea, întreținerea, reparațiile și paza integrității acestor bunuri.