(1) Autoritatea are în structura sa urmatoarele direcții generale:
a) Directia generală sanitara veterinara, condusa de un director general - medic veterinar;
b) Directia generală pentru siguranța alimentelor, condusa de un director general;
c) Directia generală pentru inspecție, control, inspecție la frontiera și coordonarea institutelor veterinare, condusa de un director general;
d) Directia generală economica, administrativa, juridica și relatii internationale, condusa de un director general.
(2) Directorii generali ai direcțiilor generale sunt numiti, în condițiile legii, prin ordin al presedintelui Autorității.
(3) În exercitarea atribuțiilor sale directorul general al Directiei generale sanitare veterinare emite decizii tehnice și poate dispune măsuri urgente în cazul unor situații deosebite în domeniul sanitar-veterinar.