(1) Plățile către beneficiari sunt efectuate în baza unui mecanism în etape. Etapele au în vedere stadiile tehnice ale investițiilor sau etapele de execuție ale acestora și sunt definite în documentația procedurilor de selecție a propunerilor de investiții elaborată de Ministerul Energiei sau organismele delegate, cu avizul acestuia.
(2) Beneficiarul are obligația depunerii de cereri de rambursare. Perioada dintre două cereri de rambursare nu poate depăși doi ani.
(3) Prin derogare de la prevederile art. 52 alin. (10¹) din Legea nr. 500/2002 privind finanțele publice, cu modificările și completările ulterioare, sumele reprezentând plăți în avans pentru implementarea proiectelor și acțiunilor finanțate din Fondul pentru modernizare pot fi justificate prin bunuri livrate, lucrări executate și servicii prestate până la termenul stabilit pentru plata finală conform contractelor încheiate, cu respectarea eventualelor prevederi specifice din contracte/decizii/ordine de finanțare și, după caz, memorandumuri/acorduri de împrumut.