Agenția îndeplinește următoarele atribuții:
a) întocmește și pune în aplicare planurile anuale de exploatare, întreținere și reparații ale amenajărilor de îmbunătățiri funciare declarate de utilitate publică;
b) face propuneri Ministerului Agriculturii și Dezvoltării Rurale cu privire la bugetul propriu și planul de activitate pentru exercițiul financiar următor;
c) inventariază anual amenajările de irigații, cu evidențierea distinctă a celor funcționale;
d) elaborează tarife pentru servicii de îmbunătățiri funciare, altele decât cele de irigații;
e) elaborează studii, proiecte, programe de cercetare și propuneri anuale pentru investiții în reabilitarea amenajărilor de îmbunătățiri funciare existente sau execută noi amenajări și supraveghează realizarea acestor lucrări de investiții, precum și propuneri de elemente de strategie și politici sectoriale;
f) urmărește impactul asupra mediului înconjurător al activităților de îmbunătățiri funciare și ia măsuri de diminuare sau corective în conformitate cu legislația protecției mediului;
g) asigură paza și protecția infrastructurii de îmbunătățiri funciare din cadrul amenajărilor de îmbunătățiri funciare pe care le administrează, exploatează, întreține și repară;
h) urmărește permanent starea tehnică a amenajărilor de îmbunătățiri funciare aflate în administrare;
i) desfășoară acțiuni de prevenire și protecție a amenajărilor de îmbunătățiri funciare aflate în administrarea sa față de acțiunea factorilor de risc și a calamităților naturale, fenomenelor meteorologice periculoase și a accidentelor la construcțiile hidrotehnice;
j) pregătește și pune în aplicare planurile de acțiune în cazuri de urgență;
k) emite avize tehnice pentru instalațiile care se amplasează și construcțiile care se execută în zona amenajărilor de îmbunătățiri funciare din administrarea sa;
l) elaborează și finanțează planul propriu de cercetare, proiectare și informatică;
m) coordonează și îndrumă metodologic controlul tehnic de calitate al exploatării, întreținerii și reparațiilor amenajărilor de îmbunătățiri funciare, efectuat de filialele teritoriale;
n) avizează documentațiile tehnice, contractează și finanțează lucrările de investiții contractate cu terți furnizori și verifică derularea și recepționarea lucrărilor, potrivit legii;
o) elaborează studiile privind necesarul forței de muncă pe structuri de personal, pregătirea și perfecționarea întregului personal, selectarea și promovarea acestuia în cadrul unităților din subordine;
p) organizează și aprobă planul de audit public intern, organizează controlul financiar preventiv și evidența angajamentelor conform legii, efectuează analize economice și tehnice asupra organizării și desfășurării activităților;
q) organizează și participă la activități de cooperare tehnicoeconomică internațională în domeniul îmbunătățirilor funciare, al gospodăririi apelor și protecției mediului;
r) verifică și dispune măsuri privind organizarea propriei contabilități potrivit legii;
s) organizează și desfășoară acțiuni de apărare împotriva inundațiilor, fenomenelor meteorologice periculoase și a accidentelor la construcțiile hidrotehnice, precum și pentru constituirea stocurilor de materiale și mijloace de apărare, mijloace de intervenție și avertizare, mijloace fixe și echipamente de protecție, siguranță și cazarmament, care se realizează conform normativelor în vigoare.
ș) efectuează probele tehnologice ale instalațiilor agregatelor de pompare și verifică capacitatea de transport a canalelor la începerea sezonului de irigații.
t) efectuează activități de furnizare a energiei electrice către clienți, precum și alimentarea cu energie electrică a locurilor de consum aflate în administrarea furnizorului, cu respectarea prevederilor legale în vigoare;
ț) în calitate de lider de asociere, Agenția poate reprezenta organizațiile și federațiile utilizatorilor de apă pentru irigații, membre ale Ligii utilizatorilor de apă, la procedura de achiziție publică a energiei electrice necesară, tranzacționată pe piața liberă.