(1) Agenția este condusă de un director general numit, în condițiile legii, prin ordin al ministrului agriculturii și dezvoltării rurale.
(2) Directorul general al Agenției are calitatea de ordonator secundar de credite și gestionează fondurile publice aprobate, inclusiv sumele reprezentând prefinanțare și cofinanțare prin schemele de plată FEGA și schemele de plată FEADR.
(3) Directorul general conduce activitatea Agenției și o reprezintă în raporturile cu celelalte organe de specialitate ale administrației publice centrale și locale, cu alte persoane juridice și fizice, precum și în justiție.
(4) În exercitarea atribuțiilor sale, directorul general emite decizii.
(5) Directorul general poate da împuternicire de reprezentare și altor persoane din cadrul Agenției.